Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCMT1P22061 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms