Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CAPN3P20807 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms