Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NME1P15531 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME1P15531 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME1P15531 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME1P15531 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME1P15531 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME1P15531 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NME1P15531 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME1P15531 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NME1P15531 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NME1P15531 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NME1P15531 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms