Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD46P15529 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD46P15529 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD46P15529 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms