Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG2P13727 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG2P13727 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRG2P13727 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms