Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms