Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TOP2AP11388 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TOP2AP11388 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms