Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GLI4P10075 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GLI4P10075 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GLI4P10075 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms