Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRCP08575 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
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