Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX3O95343 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX3O95343 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX3O95343 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX3O95343 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX3O95343 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX3O95343 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX3O95343 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX3O95343 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX3O95343 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX3O95343 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX3O95343 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SIX3O95343 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SIX3O95343 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SIX3O95343 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SIX3O95343 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SIX3O95343 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SIX3O95343 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SIX3O95343 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SIX3O95343 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SIX3O95343 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms