Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
DENRO43583 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
DENRO43583 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
DENRO43583 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DENRO43583 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms