Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXO3O43524 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms