Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
J3QRK9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
J3QRK9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
J3QRK9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
J3QRK9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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