Protein–RNA interactions for Protein: A6NK97

SLC22A20, Solute carrier family 22 member 20, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A20A6NK97 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC22A20A6NK97 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms