Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM247A6NEH6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms