Protein–RNA interactions for Protein: V9GYY9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYY9 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
V9GYY9 AC131888.1-201ENST00000625028 2168 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
V9GYY9 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
V9GYY9 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
V9GYY9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
V9GYY9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
V9GYY9 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
V9GYY9 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
V9GYY9 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
V9GYY9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
V9GYY9 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
V9GYY9 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
V9GYY9 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
V9GYY9 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
V9GYY9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
V9GYY9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
V9GYY9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
V9GYY9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
V9GYY9 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
V9GYY9 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
V9GYY9 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms