Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4BQ9Y4P1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms