Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HPS5Q9UPZ3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HPS5Q9UPZ3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms