Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RIMS3Q9UJD0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms