Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP36Q9P275 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
USP36Q9P275 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms