Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GDE1Q9NZC3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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