Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms