Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RDH8Q9NYR8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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RDH8Q9NYR8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RDH8Q9NYR8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RDH8Q9NYR8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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RDH8Q9NYR8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RDH8Q9NYR8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RDH8Q9NYR8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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