Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ATG3Q9NT62 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms