Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms