Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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