Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RAB18Q9NP72 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RAB18Q9NP72 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms