Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SMURF2Q9HAU4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMURF2Q9HAU4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms