Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MTMR12Q9C0I1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MTMR12Q9C0I1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms