Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL4Q9C0H6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms