Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms