Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GSDMCQ9BYG8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms