Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MAP1LC3CQ9BXW4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
MAP1LC3CQ9BXW4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms