Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BRIP1Q9BX63 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms