Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RBBP8Q99708 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms