Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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