Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
LINC00208Q96KT6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms