Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CAVIN3Q969G5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms