Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NKD2Q969F2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms