Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HTRA1Q92743 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HTRA1Q92743 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms