Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FNDC9Q8TBE3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms