Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF182Q8N6D2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms