Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK0

PHC2, Polyhomeotic-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC2Q8IXK0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PHC2Q8IXK0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PHC2Q8IXK0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms