Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC103Q8IW40 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms