Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SYT9Q86SS6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms