Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT28Q7Z3Y7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms