Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF550Q7Z398 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF550Q7Z398 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms