Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
ANKRD54Q6NXT1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ANKRD54Q6NXT1 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms