Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UBAP2Q5T6F2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms