Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ACSM3Q53FZ2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACSM3Q53FZ2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms